CRISPR意想不到的应用:一种新颖的方式保护细菌免受病毒感染

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majer 【奇闻趣事网】399718.com04.29 , 12:49

CRISPR意想不到的应用:一种新颖的方式保护细菌免受病毒感染

一项新研究发现,CRISPR不仅能够在细菌中识别和切割入侵病毒的DNA,还能够与其他蛋白质协同作用,增强细菌对病毒的防御。研究人员发现,一种叫做Csx28的漏斗状蛋白能够在CRISPR的激活下,扰乱细菌的膜的通透性,使得病毒DNA难以在细菌内部复制。这一发现是“出乎意料的,并引发了各种新的问题”,圣路易斯罗切斯特大学的生物化学家马克·杜蒙特(Mark Dumont)说。他是这项研究的合作者之一。
这项研究涉及了一系列实验,其中大肠杆菌被一种感染细菌的病毒或噬菌体(enterobacteria phage λ)感染。这种噬菌体像登月舱一样附着在细菌表面,并将其DNA注入细胞内,制造自己的复制品。
大肠杆菌则利用CRISPR进行反击,通过匹配之前遇到过的噬菌体的重复DNA片段来识别威胁,然后使用一种叫做Cas13b的酶将入侵的DNA切成碎片。
研究人员发现,当Csx28存在于细菌内部时,病毒的复制速度变慢了。这种蛋白只有在与Cas13b一起工作时才有效,这表明它们两者之间有协调作用,共同消灭病毒。
当Cas13b和Csx28同时存在时,释放出感染性病毒颗粒的细菌比例从大约19%降低到大约3%,而且每毫升的噬菌体数量也显著减少。换句话说,病毒没有像平常那样能够大量复制。
研究人员使用一种叫做冷冻电子显微镜的技术检查了Csx28蛋白的结构,发现它像一个漏斗,中间有一个孔。这引起了一种可能性,即该蛋白形成了一个膜孔,并且干扰了细胞的代谢,使其成为一个不利于病毒生存的环境。
研究人员使用一种技术来测试这个假设,该技术可以使细胞在失去其膜电位后发出荧光。膜电位是@于细胞内外离子浓度差而产生的一种小电荷。他们发现,两种蛋白一起导致膜去极化,使得大量带电原子涌入,从根本上改变了细胞的内部环境。在90分钟后,40%的细菌群体以这种方式去极化了。
“当你阅读这篇论文时,你会想……‘什么?’这是什么奇怪的机制。”罗切斯特大学的分子生物学家约翰·卢克(John Lueck)说。他没有参与这项研究。
“令人印象深刻的是,该团队发现了这种与我们之前见过的任何东西都不相似的孔状蛋白,”他说。“这很令人兴奋,因为在科学中,当你触及某个新颖东西的表层时,常常会发现表层之下藏着一个全新的世界。”
这篇论文发表在《科学》上。
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